寺院每日早课先念诵“楞严咒”、“大悲咒”和“十小咒”。然后诵《心经》、《药师赞》等
1、“楞严咒”出自《楞严经》
2、“大悲咒”出自《千手千眼观世音菩萨广大圆满无碍大悲心陀罗尼经》
3、“如意宝轮王陀罗尼”出自《如意轮陀罗尼经》，也属观世音菩萨法门
4、“消灾吉祥神咒”出自《佛说炽盛光大威德消灾吉祥陀罗尼经》
5、“功德宝山神咒”，出处不明，有一部《密咒圆因往生集》说此咒出自《大集经》，但现存《大集经》中无此咒。
6、“准提神咒”出自《佛说七俱胝佛母准提大明陀罗尼经》
7、“圣无量寿决定光明王陀罗尼”，《佛说大乘圣无量寿决定光明王如来陀罗尼经》中有此咒，但文字与早晚课所诵不同。应出自另一译本，经本佚失，有说是元代翻译。
8、“药师灌顶真言”，出《药师琉璃光七佛本愿功德经》
9、“观音灵感真言”，元代翻译，没有经
10、“七佛灭罪真言”，出《陀罗尼杂集》。
11、“往生净土神咒”，出自《拔一切业障根本得生净土神咒》
12、“大吉祥天女咒”，出自《金光明经》
然后念诵《般若波罗蜜多心经》。然后“药师赞”“药师灌顶真言”等，与《药师琉璃光七佛本愿功德经》《药师琉璃光如来本愿功德经》有关。
晚课先念诵《阿弥陀经》。然后“礼佛大忏悔文”，然后“蒙山施食仪”。
礼佛大忏悔文，俗称拜八十八佛。八十八佛是《观药王药上二菩萨经》的五十三佛，加上《决定毗尼经》的三十五佛，《三十五佛名礼忏文》中也有三十五佛。偈颂出自《普贤行愿品》。
然后是蒙山施食仪。先念《华严经》觉林菩萨偈，中间有“南无《大方广佛华严经》”，《心经》。有多个真言：
1、“破地狱真言”
2、“普召请真言”
3、“解冤结真言”
4、“地藏菩萨灭定业真言”
5、“观音菩萨灭业障真言”
6、“灭障碍开咽喉真言”
7、“三昧耶戒真言”
8、“变食真言”
9、“甘露水真言”
10、“一字水轮咒”
11、“乳海真言”
12、“施无遮真言”
13、“普供养真言”
14、“普回向真言”
15、“往生净土神咒”， 出自《拔一切业障根本得生净土神咒》
这里的很多咒不知道出自哪里，有说出自《陀罗尼杂集》，不知是否准确。
中间还有七佛名号：
1、南无多宝如来，出自《法华经》
2、南无宝胜如来，出自《地藏经》
3、南无妙色身如来
4、南无广博身如来
5、南无离怖畏如来
6、南无甘露王如来
7、南无阿弥陀如来，出自《阿弥陀经》